Để từng bước đáp ứng nhu cầu về nhân lực an toàn thông tin ngày càng tăng trong cả lĩnh vực quốc phòng - an ninh và kinh tế - xã hội của đất nước, cuối năm 2012, Học viện Kỹ thuật Mật mã đã được Bộ Giáo dục và Đào tạo cho phép tổ chức đào tạo để cấp bằng tốt nghiệp Đại học thứ hai chuyên ngành An toàn thông tin - ngành Công nghệ thông tin (mã ngành đào tạo: 5248020).